Dans un soucis de cohérence nationale (MhéO), les protocoles retenus sont identiques aux protocoles créés dans le cadre du programme RhoMéO (http://rhomeo-bao.fr/).
Afin de répondre aussi à l'objectif de Suivi de travaux de restauration, il est fortement recommandé de lire le 'guide méthodologique d'utilisation des indicateurs pour le suivi des travaux de restauration' (http://rhomeo-bao.fr/sites/all/themes/corporateclean/pdf/Guide_Restauration_BAO_RhoMeO.pdf).
Les documents ci-dessous proviennent de la BAOMH LigérO (en cours de finalisation). Ce travail réalisé sur le bassin de la Loire, avec une intégration prochaine de la Bretagne, est basé sur la BAOZH RhoMéO. Le principal travail a été d'adapter le document au bassin de la Loire.